Cơ cấu tổ chức của Ban Quản lý Lăng Chủ tịch Hồ Chí Minh được quy định tại Điều 3, Nghị định số 61/2022/NĐ-CP ngày 12/9/2022 của Chính phủ như sau:

1. Ban Quản lý Lăng Chủ tịch Hồ Chí Minh

   1. Văn phòng Ban Quản lý Lăng Chủ tịch Hồ Chí Minh
   2. Các đơn vị sự nghiệp công lập

      1. Ban Quản lý Quảng trường Ba Đình
      2. Trung tâm Khoa học, Công nghệ và Môi trường
   3. Các đơn vị chuyên trách phối thuộc

      1. Bộ Tư lệnh Bảo vệ Lăng Chủ tịch Hồ Chí Minh, Bộ Quốc phòng
      2. Trung đoàn 375, Bộ Tư lệnh Cảnh vệ, Bộ Công an